Onderwijs

De Hanze Sequency Facility biedt verschillende onderwijsmodules aan over Next Generation Sequencing. Deze modules zijn zowel toegankelijk voor studenten van de Hanze als externen. Dit zijn modules, die in samenwerking met het Hanze DataLab worden gegeven, en inzicht geven in praktische web-lab Next Generation Sequencing-bediening en dry-lab Next Generation Sequencing bioinformatische analyse.

De praktisch vormgegeven modules zijn gebaseerd op de Oxford Nanopore long-read (MinION) en de Illumina short-read (MiSeq) platforms. Deze modules zijn onderdeel van de bachelor- and masteropleidingen in bio-informatica and data science die door de Hanze worden aangeboden. Voor deze studies hebben docenten van de Hanze verschillende Next Generation Sequencing practica ontwikkeld. Voorbeelden hiervan zijn:

• Metagenomische sequentiebepaling van het bodemmicrobioom: onderzoek naar zoutstress in tarwevelden in Noord-Friesland (februari 2025)
• Metagenomische sequentiebepaling van het darmmicrobioom: invloed van chilipepers op de darm (december 2024)
• Metagenomische sequentiebepaling van het huidmicrobioom: de inzet van verschillende handontsmettingsmiddelen (december 2023)
• Methylatiesequentiebepaling van de Jurkat-kankercellijn: de effecten van betulinezuur op kankerbehandeling (december 2023)

• Directe RNA-sequentiebepaling: snelle detectie van bijenhemolymfevirosomen (januari 2020)

Samenwerking met onderwijs- en kennisinstellingen
Regelmatig worden er nieuwe practica ontwikkeld voor de opleidingen Biomedisch Onderzoek en Biomedische Diagnostiek om de studenten voor te bereiden op de beroepspraktijk. Waar mogelijk werken we hierin graag samen met andere onderwijs- en kennisinstellingen. Om samen het Next Generation Sequencing onderwijs te versterken en studenten voor te bereiden op een carrière in de life sciences.

Incompany- en on-demandtrainingen
Aan externe partijen bieden wij de Next Generation Sequencing training aan. Deze training is beschikbaar voor zowel onderzoekers en professionals werkzaam in de academische wereld, de zorg, biotech/pharma en industriële microbiologie, als iedereen die praktische of analytische Next Generation Sequencing vaardigheden wil ontwikkelen. In 2016 en 2017 hebben we bijvoorbeeld via de IT Academy Noord-Nederland een Next Generation Sequencing-verwerkingscursus (Linux for the Lab) verzorgd voor de afdeling Medische Microbiologie van de Rijksuniversiteit Groningen.

Daarnaast bieden we on-demand Next Generation Sequencing cursussen aan. Bijvoorbeeld een inleiding in Next Generation Sequencing en cursussen over MinION sequentie-analyse, Illumina sequentie-analyse en Next Generation Sequencing-analyse.