Hanze Sequencing Facility

Bij de Hanze Sequencing Facility kunnen studenten, onderzoekers en bedrijven terecht voor alles wat te maken heeft met genetisch onderzoek op basis van DNA- en RNA-sequentiebepaling (het lezen van DNA/RNA). Hierbij bieden de onderzoekers van de Hanze Sequencing Facility volledig op maat gemaakte ondersteuning, van experimenteel ontwerp tot en met data-inzichten.

DNA kan gezien worden als een instructieboek voor het functioneren van alles wat leeft, waaronder mensen en landbouwgewassen. Waar de woorden in een boek bestaan uit de letters uit het alfabet, bestaat DNA uit vier chemische bouwstenen (basen). Het uitlezen van de volgorde van de basen in DNA of RNA wordt sequentiebepaling genoemd. Het verzamelen van DNA- en RNA-sequentiegegevens is van groot belang voor biomedisch en biotechnologisch onderzoek.

Moderne DNA- en RNA-sequentiebepalingstechnieken, oftewel Next Generation Sequencing (NGS) technieken, stellen onderzoekers in staat om sneller en nauwkeuriger grote hoeveelheden DNA of RNA uit te lezen. Hierdoor ontstaat inzicht in het genetische materiaal, hoe het biologische proces werkt, wat de mogelijke afwijkingen zijn en hoe deze kunnen worden verholpen.

Voor het uitvoeren van het onderzoek beschikt de Hanze Sequencing Facility over zowel Illumina (short read) als Oxford Nanopore platformen (long reads). Onze specialisten bieden deskundig advies over diverse sequentiebepalingsmethoden en het genereren van zinvolle data. Daarnaast is er een nauwe samenwerking tussen de Hanze Sequencing Facility en het Hanze DataLab, waar geavanceerde analyse, interpretatie en toepassing van data en kunstmatige intelligentie (AI) plaatsvindt.

Sectoren
De Hanze Sequencing Facility is actief in meerdere sectoren, zoals de zorg-, voedings- en landbouwsector, de biotechnologische sector, en binnen de groene economie. Met onze kennis en apparatuur dragen we bij aan kankeronderzoek, de ontwikkeling van regeneratieve landbouw en oplossingen voor voedselveiligheid.

Ontstaan van de Hanze Sequencing Facility
De Hanze Sequencing Facility is verbonden aan de lectoraten Data Science for Life Sciences & Health en Biomolecules & Health en is in 2016 opgezet vanuit het Kenniscentrum Biobased Economy van de Hanze. Sinds het begin zijn er meer dan 100 bioinformatica studenten opgeleid en 30 onderzoeks- en studieprojecten uitgevoerd. In totaal heeft dit tot nu toe 320 miljard basen aan sequentiedata opgeleverd, wat gelijk staat aan 100 menselijke genomen.